ФГБУ «ЦСП» ФМБА России продолжает развивать инструменты из области биоинформатики для персонализированной медицины. Специалистами учреждения разработана программа для ЭВМ «Неоантигенный пайплайн», предназначенная для выявления индивидуальных неоантигенов пациента. Свидетельство о государственной регистрации № 2026684894 выдано 18 августа 2026 г.

Программа предназначена для исследования молекулярных особенностей опухолей человека и позволяет в автоматизированном режиме осуществлять поиск индивидуальных неоантигенов пациента. Анализ проводится на основе данных полногеномного и транскриптомного секвенирований опухолевой ткани, а также полногеномного секвенирования нормальной ткани пациента.

Функциональный порядок действий программы включает несколько последовательных этапов: выравнивание данных полногеномных секвенирований, определение соматических мутаций в опухоли и их аннотацию, определение HLA-аллелей, подсчёт экспрессий транскриптов в опухоли с последующим добавлением значений в файл с соматическими мутациями и непосредственно поиск потенциальных неоантигенов. Разработка основана на последовательном запуске специализированных публично доступных программ, что обеспечивает высокую точность и воспроизводимость результатов.

Программа «Неоантигенный пайплайн» может быть применена в онкологических исследованиях для разработки персонализированных подходов к иммунотерапии. Разработка специалистов учреждения вносит вклад в развитие персонализированной медицины в области биоинформатики и молекулярной онкологии.