Специалистами ФГБУ «ЦСП» ФМБА России зарегистрирована программа для ЭВМ «VirALLPipe», предназначенная для сборки и анализа геномных последовательностей вирусов в данных метагеномного секвенирования биологических образцов, полученных от животных. Её внедрение позволит решать ключевые задачи в области эпидемиологии и молекулярной диагностики вирусных заболеваний.

Получено свидетельство о государственной регистрации программы для ЭВМ № 2025688547 от 21.10.2025.

«VirALLPipe» автоматизирует комплексный анализ данных:

• Первичную обработку: фильтрацию и очистку сырых данных для удаления низкокачественных чтений.
• Сборку геномов: использование алгоритмов de novo для реконструкции полных или частичных вирусных геномов из сложной метагеномной смеси.
• Таксономическую идентификацию: выделение и классификацию вирусных таксонов.
• Полировку вирусных контигов: улучшение качества собранных последовательностей для минимизации ошибок.
• Формирование отчета: автоматическую генерацию итогового документа с результатами сборки и аннотации.

Разработка направлена на исследование вирусного разнообразия в природных резервуарах инфекций, что критически важно для раннего выявления новых патогенов и мониторинга потенциальных угроз. Положительный эффект от внедрения программы включает усиление возможностей по изучению природных очагов инфекций и оперативному отслеживанию появления новых возбудителей заболеваний.