8 июня 2024 года ФГБУ «ЦСП» ФМБА России получено свидетельство о государственной регистрации программы для ЭВМ «Pathogenid» № 2024664164.

Pathogenid обрабатывает данные высокопроизводительного секвенирования и предназначена для анализа и изучения биологического разнообразия патогенов вирусной, бактериальной и грибковой природы, а также поиска новых патогенов в биологических образцах.

Программа предоставляет пользователю возможность анализа нуклеиновых кислот бактериальных, грибковых или вирусных патогенов, генетических детерминант лекарственной устойчивости, выделенных из биологического образца и процессированных с использованием протоколов, основанных на таргетном обогащении целевых (маркерных) локусов и применении высокопроизводительного секвенирования.

Данное программное обеспечение обеспечивает возможность осуществления в автоматическом режиме таксономической идентификации возбудителей инфекций, выдачи отчета (заключения) об исследовании и подготовки геномных последовательностей к занесению в базу данных. Применение разрабатываемых подходов в формате широкого скрининга позволит осуществлять динамическое наблюдение за эпидемиологическим профилем заболеваемости инфекционными заболеваниями, систематизировать информацию о циркулирующих патогенах, проводить анализ их таксономической структуры.

Программа может применяться для идентификации патогенов любой природы, в случае, если не удается установить причину заболевания стандартными диагностическими методами, и кроме того, обладает функционалом для определения известных генетических детерминант лекарственной устойчивости.