ФГБУ «ЦСП» ФМБА России получен патент на изобретение «Тест-система и способ для обнаружения специфических фрагментов нуклеиновых кислот 16 патогенов с использованием изотермической реакции амплификации»

Специалистами Центра стратегического планирования и управления медико-биологическими рисками здоровью ФМБА России разработан способ для обнаружения специфических фрагментов нуклеиновых кислот 16 патогенов с использованием изотермической реакции амплификации. Получен патент на изобретение № 2810751от 28.12.2024.

Объектом исследования стала тест-система на основе ДНКзимов для in vitro диагностики специфических последовательностей нуклеиновых кислот. В результате исследования были разработаны уникальные реагенты и протоколы для выделения нуклеиновых кислот из клинического образца, изотермической амплификации и последующей визуализации продуктов амплификации методом флуоресцентного анализа с использованием уникальных ДНКзимных сенсоров.

Полученные результаты показали, что разработанные реагенты позволяют обнаруживать и идентифицировать нуклеиновые кислоты 16 патогенов, Neisseria meningitidis, Streptococcus pneumoniae, Haemophilus influenzae, Escherichia coli Kl, Listeria monocytogenes, Streptococcus agalactiae, Herpes simplex virus 1, Herpes simplex virus 2, Varicella Zoster virus, Mycobacterium tuberculosis, Cytomegalovirus, Human herpesviruses 6, Epstein Barr virus, Enterovirus, Streptococcus aureus и Candida albicans, в количестве от 50 геномных эквивалентов в образце в течение двух часов.

Реагенты разрабатывались в первую очередь с целью создания тест-системы для диагностики инфекционных заболеваний центральной нервной системы. Нейроинфекции часто ассоциированы с высоким уровнем инвалидизации и смертности и могут быть вызваны широким спектром патогенов, включая бактерии, вирусы, грибы и простейшие. На исход заболевания критическое влияние оказывают скорость определения возбудителя инфекции и подобранная этиологически направленная терапия.

Полученные специалистами ФГБУ «ЦСП» ФМБА России реагенты позволяют заменить время- и трудозатратные микробиологические диагностические исследования мультиплексной тест-системой на основе молекулярно-генетических методов. На данный момент существует зарубежный аналог, Meningitis/Encephalitis (ME) Panel тест-системы FilmArray (Biofire), однако стоимость одного тестирования составляет порядка 200 долларов США, в то время как стоимость одного тестирования с использованием реагентов, разработанных в ФГБУ «ЦСП» ФМБА России, составит менее 1000 рублей.

Внутренние исследования реагентов показали, что помимо диагностики нейроинфекций, тест-система может быть использована для обнаружения предварительно выделенных нуклеиновых кислот Neisseria meningitidis, Streptococcus pneumoniae, Haemophilus influenzae, Escherichia coli Kl, Listeria monocytogenes, Streptococcus agalactiae, Herpes simplex virus 1, Herpes simplex virus 2, Varicella Zoster virus, Mycobacterium tuberculosis, Cytomegalovirus, Human herpesviruses 6, Epstein Barr virus, Enterovirus, Streptococcus aureus и Candida albicans в других клинических образцах, что значительно расширяет спектр потенциальных нозологий для применения полученной разработки.